精準醫(yī)學(xué)熱潮下 基因檢測技術(shù)飛速發(fā)展
matthew 2015.10.30 22:42 基因測序概念股
在精準醫(yī)學(xué)時代,先進檢測技術(shù)的發(fā)展為罕見病的診治提供了新希望。然而,在近日舉辦的第四屆中國罕見病高峰論壇上,與會專家指出,僅僅依賴基因檢測等技術(shù)手段的進步并不能為罕見病的診治提供全面的解決方案,必須借助于更多領(lǐng)域、更多學(xué)科的配合,特別是臨床遺傳學(xué)專業(yè)人員對檢測結(jié)果的科學(xué)解讀,才能真正造福于罕見病患者。
復(fù)旦大學(xué)出生缺陷研究中心常務(wù)副主任馬端教授介紹,根據(jù)美國國立衛(wèi)生研究院的統(tǒng)計,目前已知的罕見病約有7000種,其中絕大多數(shù)是單基因遺傳病。只有了解疾病的病因,才能夠?qū)崿F(xiàn)診治的精與準。目前,基因測序能力大大提高,成本大大下降,生物信息學(xué)的發(fā)展已經(jīng)使得我們可以去解讀測序中發(fā)現(xiàn)的問題。馬端表示,基因檢測有兩個價值:一是研究價值,尋找遺傳學(xué)的病因,確定檢測標志物和治療靶點;二是臨床應(yīng)用價值,可以開展遺傳病基因的檢測與分析,進行遺傳咨詢和科研服務(wù)等。
“基因檢測已經(jīng)成為罕見病診斷與防治的重要手段?!比A大基因執(zhí)行總裁尹燁指出,“在基因上沒有人是完美的,平均每個人都會攜帶30個遺傳疾病的缺陷?!被驒z測技術(shù)不但能夠驗證疾病的臨床診斷,為患者提供準確的遺傳咨詢服務(wù),還能用于致病基因攜帶者的檢測與產(chǎn)前診斷。
尹燁舉例說,通過基因檢測有效防治遺傳病在歷史上不乏成功的范例。在猶太人群中曾流行一種名為TSD的罕見病,即失明綜合征。該病屬于遺傳性出生缺陷,有該缺陷的患兒出生后很快會失明,并且伴隨各個系統(tǒng)器官衰竭,出生約4個月就可能死亡。為了控制這一疾病,猶太人依托教會,通過所有主流媒體進行宣傳,開展大規(guī)模的孕前篩查。結(jié)果到2000年,北美地區(qū)的猶太人群中TSD的發(fā)病率降低了90%;2003年,全美診斷出的10個TSD患兒中,沒有1個是猶太人。
罕見病發(fā)展中心主任黃如方認為,目前,罕見病患者迎來了最好的時代:在精準醫(yī)學(xué)的熱潮下,基因檢測技術(shù)得到飛速的發(fā)展和應(yīng)用。目前,我國的基因檢測技術(shù)已經(jīng)走在世界前列,檢測的費用也已經(jīng)降到1000元以內(nèi),大大提高了基因檢測技術(shù)在臨床診斷中的應(yīng)用,有效提高了患者的診斷率,縮短了確診時間,降低了確診成本。
科學(xué)解讀決定精準診治
北京協(xié)和醫(yī)院黃尚志教授指出,基因檢測技術(shù)雖然在短短數(shù)年內(nèi)取得了長足進步,但對罕見病而言,僅僅依靠技術(shù)的進步還遠遠不夠。因為檢測出的基因缺陷未必就一定會致病,呈現(xiàn)出來的表現(xiàn)型是基因型和后天環(huán)境共同導(dǎo)致的,基因型和表現(xiàn)型之間的對應(yīng)關(guān)系尚待研究。也就是說,即使通過基因檢測發(fā)現(xiàn)了致病基因,也并不表明100%已患上或?qū)⒒忌线@種疾病。
“基因檢測的結(jié)果需要被科學(xué)解讀,只有被正確解讀的結(jié)果才有意義?!秉S尚志認為,精準醫(yī)學(xué)的精髓在于把握患者的個體化差異,這就需要臨床醫(yī)生根據(jù)患者的病史、表型,結(jié)合基因檢測結(jié)果來加以判斷,基因檢測只是幫助臨床醫(yī)生做出正確判斷的重要工具。
“患者是否需要做基因檢測或者產(chǎn)前檢測,需要個體化處理。”中日醫(yī)院運動障礙與神經(jīng)遺傳病研究中心負責(zé)人顧衛(wèi)紅研究員也這樣表示。他說,雖然基因檢測技術(shù)飛速發(fā)展,但是對于基因結(jié)構(gòu)的認識相對不足,使得基因檢測的臨床應(yīng)用尚存不少問題。比如,二代測序?qū)币姴〉脑\斷非常重要,但缺乏質(zhì)控,尤其是解讀環(huán)節(jié)較為薄弱。細致可靠的臨床表型的采集至關(guān)重要,應(yīng)選擇適合的檢測方法,結(jié)合表型分析進行基因檢測結(jié)果的解讀。臨床表型的數(shù)據(jù)與基因數(shù)據(jù)是否能被整合在一起,能否被準確地分析和解讀非常重要,這也是目前所欠缺的,臨床表型如何與疾病分類、遺傳模式銜接仍需進一步分析。
馬端也強調(diào),基因檢測不等同于簡單的基因測序,最為關(guān)鍵的是把測序出來的結(jié)果解讀好,為疾病防治服務(wù)。這需要做好三件事情:一是疾病的評估;二是疾病的基因診斷;三是通過基因檢測指導(dǎo)臨床用藥。
“我國的測序技術(shù)已經(jīng)領(lǐng)先,但測的越多,亂的越多。”同濟大學(xué)附屬第一婦嬰保健院院長段濤教授認為,主要的原因在于沒有合適的人員對結(jié)果進行解讀,提高基因檢測結(jié)果解讀的精確性迫在眉睫。
段濤解釋說,由于我國臨床遺傳學(xué)專業(yè)人員和遺傳學(xué)咨詢師的缺失,使得臨床醫(yī)生拿到基因檢測結(jié)果往往不會解讀。在歐美國家,有受過專門培訓(xùn)的臨床遺傳學(xué)家與遺傳咨詢師來對患者進行遺傳咨詢,但是在我國根本沒有這兩種專業(yè)體系。專業(yè)教育和培訓(xùn)體系的缺失,導(dǎo)致我國搞遺傳學(xué)研究的人不懂臨床,搞臨床的人不懂遺傳學(xué),也不懂臨床遺傳學(xué)。沒有正確的解讀,就不可能將基因檢測技術(shù)真正造福于人類。
段濤呼吁,相關(guān)人員的培訓(xùn)和教育是重要的環(huán)節(jié),我國亟需建立“臨床遺傳學(xué)”學(xué)科,在高校中開展臨床遺傳學(xué)教育,培養(yǎng)專業(yè)人才,為罕見病患者提供正確的臨床意見。馬端則建議,除了參加臨床遺傳學(xué)的再教育外,臨床醫(yī)生也應(yīng)加強相關(guān)知識的自學(xué)。
加強資源共享平臺建設(shè)
目前,國內(nèi)基因檢測領(lǐng)域的公司之間交流甚少,彼此數(shù)據(jù)庫之間沒有形成共通。這使得許多需要進行大數(shù)據(jù)比對的基因檢測結(jié)果只能在有限的數(shù)據(jù)空間內(nèi)進行。尹燁建議,未來,在國家層面應(yīng)建立數(shù)據(jù)互通的基因檢測、疾病表型、患者信息共享大數(shù)據(jù)庫,從而可以大幅度提高診斷速度和診治的準確性。
顧衛(wèi)紅談道,科技的發(fā)展和現(xiàn)有的診療模式存在矛盾?;驒z測技術(shù)如今遠遠跑在前面,而臨床表型的收集和分析則明顯滯后。很多醫(yī)生并不了解基因檢測技術(shù)和業(yè)務(wù)的流程,缺乏相關(guān)的培訓(xùn)和繼續(xù)教育,檢測質(zhì)量也參差不齊。醫(yī)生、患者、檢測公司之間的連接松散,缺乏有效的交流平臺,模糊的臨床表型與二代測序大量的基因數(shù)據(jù)建立連接容易出現(xiàn)問題。她強調(diào),當前我國的醫(yī)療資源分散,基因數(shù)據(jù)應(yīng)實現(xiàn)積累和共享,應(yīng)盡可能地整合和開放健康人數(shù)據(jù)和不同種族、不同類型疾病的患者數(shù)據(jù),并讓更多人參與數(shù)據(jù)的解讀。
受訪專家均表示,希望測序公司都能盡可能地整合和開放數(shù)據(jù),能將數(shù)據(jù)提交給醫(yī)生,利用“互聯(lián)網(wǎng)”將數(shù)據(jù)共享,供各國的科學(xué)家進行特定的研究。不過,這也會涉及到一系列的倫理道德問題,所以是一個長期努力的過程。同時,對基因測序檢測結(jié)果的判斷,還需要加強各學(xué)科之間的交流,需要整合多方面信息,包括臨床信息、檢測技術(shù)的選擇、測序數(shù)據(jù)的最終解讀等等。只有各學(xué)科協(xié)作,才能給罕見病患者以滿意的答復(fù)。
段濤強調(diào),基因檢測至關(guān)重要,但解決罕見病的臨床問題更需要一個整體解決方案,不僅包括由婦產(chǎn)科醫(yī)生、兒科醫(yī)生、臨床遺傳醫(yī)生組成的臨床團隊和以測序平臺為基礎(chǔ)的罕見病診斷平臺,還要與其他罕見病臨床機構(gòu)、實驗室、研究機構(gòu)、醫(yī)藥公司、政府組織、非政府組織加強合作。
顧衛(wèi)紅也呼吁,術(shù)業(yè)有專攻,合作非常重要,要通過臨床、科研、產(chǎn)業(yè)、公益、政策法規(guī)等方面的合作共同推動罕見病的有效診治。
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